Biotechnologia.pl
łączymy wszystkie strony biobiznesu
Test sprzętu laboratoryjnego: Genetic Analyzer 3130 Applied Biosystems®
Anna Staszewska, 13.03.2014
W kolejnej odsłonie z cyklu artykułów „Praktycy dla praktyków: testy sprzętu laboratoryjnego”, prezentujemy niezależną opinię na temat użytkowania sprzętu laboratoryjnego, przygotowaną przez pracownika Celther Polska. Firma prowadzi dwa laboratoria biologii komórki i obrazowania.

Applied Biosystems® 3130 Genetic Analyzer jest sekwenatorem, który wykorzystuje elektroforezę kapilarną. Urządzenie jest łatwe w obsłudze i w pełni zautomatyzowane, począwszy od załadunku polimeru, poprzez wprowadzenie próbek, aż po ich oznaczenie i analizę danych. Zaletą jest fakt, że kapilara wytrzymuje dwa razy więcej sekwencjonowań niż przewiduje producent. Ponadto producent gwarantuje zsekwencjonowanie do 960 par zasad, podczas gdy w praktyce, używając odpowiedniej jakości materiału, można osiągnąć wydajność nawet do ponad 1500 par zsekwencjonowanych zasad.

 

Oczywistym dla użytkownika powinien wydawać się fakt, że w pobliżu sprzętu należy maksymalnie dbać o czystość, jak najmniejszą ilość kurzu i pyłu oraz zapewnić właściwą cyrkulację powietrza. 

Sekwenator wyposażony jest w 4 kapilary, dzięki czemu jest możliwość zsekwencjonowania jednocześnie 96 próbek. Ponadto, istnieje możliwość użycia kapilar o 4 różnych długościach (najdłuższa 80 cm), dzięki czemu możliwa jest analiza sekwencyjna dłuższych produktów reakcji. 

Urządzenie obsługiwane jest przez 3 programy: Sequencing Software, SeqScape Software oraz GeneMapper Software, do następujących aplikacji, np.: 

  • sekwencjonowanie de novo
  • sekwencjonowanie porównawcze, 
  • resekwencjonowanie (VariantSEQr, mitoSEQr), 
  • minisekwencjonowanie (detekcja SNP), 
  • identyfikacja heterozygot, 
  • identyfikacja osobnicza ludzi, 
  • identyfikacja bakterii i grzybów do gatunku (MicroSeq), 
  • genotypowanie koni, psów, bydła (StockMarks), 
  • AFLP mikroorganizmów i roślin, 
  • analiza sprzężeń (Linkage Mapping Set), 
  • analiza SNP (SNaPshot, SNPlex), SSCP, HMA, LOH, MLPA.

Zaletą sekwenatora kapilarnego niewątpliwie jest to, że wymaga on mniejszej ilości próbki DNA w porównaniu z technologią wykorzystującą elektroforezę żelową. Ponadto, ulepszona regulacja temperatury sprawia, że wyniki są dokładniejsze i powtarzalne.

 

Dalsza część opisu dpostępna POD TYM ADRESEM

 

 

 

 

Źródła

LABORANT.PL

KOMENTARZE
news
pn wt śr cz pt sb nd
27 28 29 30
Ergonomia pipetowania
2026-04-30 do 2026-04-30 Czytaj więcej
1 2 3
4 5
Estetica Expo 2026
2026-05-05 do 2026-05-07 Czytaj więcej
6 7 8 9 10
11 12 13 14
MEETUP 404
2026-05-14 do 2026-05-14 Czytaj więcej
BioOpen
2026-05-14 do 2026-05-15 Czytaj więcej
15 16 17
18 19 20 21
MEDmeetsTECH #21
2026-05-21 do 2026-05-21 Czytaj więcej
22 23 24
25 26 27
UK Biotech Day 2026
2026-05-27 do 2026-05-28 Czytaj więcej
28 29
Carpatia Diagnostica
2026-05-29 do 2026-05-29 Czytaj więcej
30 31
Newsletter