Technoinkubator ma zapewniać przedsiębiorcom pomoc w stworzeniu własnej firmy i wdrażaniu opracowanej przez nich nowej technologii. Będzie on szansą dla profesorów, także dla studentów i doktorantów, którzy prowadzą badania nad technologiami przydatnymi w przemyśle. W Jagiellońskim Centrum Innowacji znajdą sprzęt niezbędny do badań i warunki do prowadzenia firmy. Inkubator powstanie na terenie III Kampusu UJ w Pychowicach. Jego budowa została podzielona na dwa etapy. W 2007 roku ma powstać budynek o powierzchni 5 tys. m kw. z infrastrukturą badawczą i produkcyjną dla około 70 nowych firm. W 2009 r. ta powierzchnia zostanie podwojona. Głównymi kierunkami działalności firm ma być biotechnologia, farmacja, medycyna, fizyka, chemia, ale i badania nad nowymi metodami zarządzania i organizacji. Jeszcze w tym roku w budynkach kampusu UJ w Pychowicach powstanie minitechnoinkubator, w którym działać będzie około dziesięciu już powstających nowych firm.