Replikacja wirusa jest regulowana na wielu poziomach, w tym z użyciem konserwatywnych sekwencji genomowego RNA. Najsilniejszymi elementami regulatorowymi w wirusowym RNA są jak dotąd niezidentyfikowane jej składniki. W ostatnim Nature zespół autorów scharakteryzował strukturę całego genomu wirusa HIV-1 z dokładnością do jednego nukleotydu. W trakcie badań wykorzystywano metodę SHAPE.
Genom wirusa koduje białka na dwóch poziomach. Dodatkowo, poza podobieństwem między RNA a pierwotną strukturą białek, istnieje korelacja pomiędzy struktura RNA oraz sekwencjami kodującymi wewnątrzdomenowe pętle w białkach wirusa HIV. Korelacja ta sugeruje, że struktura RNA moduluje wydłużanie rybosomów i pierwotne fałdowanie białek.
Źródło: Architecture and secondary structure of an entire HIV-1 RNA genome, Nature 460, 711-716 (6 August 2009)
Odszyfrowano genom HIV-1
13.08.2009
KOMENTARZE