GeoChip opisany został w jednym z ostatnich numerów The ISME journal. To nowe, opierające się na genomice narzędzie może być użyte do wykrywania funkcjonalnych genów i procesów w zespołach mikroorganizmów. Posiada niezwykle dużo interesujących aplikacji. Obecnie niewiele wiadomo na temat drobnoustrojów i tego jak funkcjonują w zespołach, jako społeczność. GeoChip jest nowym typem technologii opartej na chipach genetycznych, opracowanym przez Jizhong Zhou i WSP. GeoChip zawiera kolekcję mikroskopijnych plamek DNA umieszczonych na małej płytce, a każda z tych kropek-plamek odpowiada innej sondzie genetycznej. GeoChip posiada około 24000 takich sond ze wszystkich znanych drobnoustrojów związanych ze zróżnicowanymi biogeochemicznymi, ekologicznymi i środowiskowymi procesami. Sondy użyte do produkcji GeoChip są wysoce specyficzne i obejmują ponad 150 funkcjonalnych grup genów związanych z obiegiem azotu, węgla, siarki i fosforu, redukcją metali i degradacja zanieczyszczeń. To pierwszy dokładny i bardzo uniwersalny chip genetyczny do badań związanych z mikrobiologią środowiskową. Chip został skutecznie przetestowany w obszarze badań bioremediacyjnych. Został użyty do monitorowania zespołów mikrobiologicznych w redukowaniu poziomu uranu w zanieczyszczonej nim wodzie gruntowej. Wyniki tych badań pokazały, że GeoChip potrafi wskazać geny, których aktywność koreluje z geochemią procesu oraz udziałem określonych drobnoustrojów. Bioremediacja jest jednym z wielu zastosowań nowej techniki. Autorzy odkrycia wskazują na zastosowanie GeoChip w takich obszarach badań jak ekologia lasów, obszarów trawiastych, bioreaktorów czy systemów uzdatniania wody.


The ISME Journal